Модель прогноза опухолей ЦНС у переживших онкозаболевание в детстве

Дети, получавшие краниоспинальное облучение, имеют в дальнейшем повышенный риск злокачественных образований ЦНС. Однако прогнозировать вероятность опухолей головного и спинного мозга у каждого конкретного пациента затруднительно. В последнем номере Journal of Clinical Oncology специалистами Университета Северного Техаса (Дентон, США) было опубликовано исследование по созданию для этой группы объективной рисковой модели, предполагающей генетическую детерминированность вторичных опухолей ЦНС.

В качестве генов-кандидатов было выбрано 46 позиций на основе проведенных ранее исследований первичных опухолей головного мозга за период с 2005 по 2014 год и зарегистрированных в системах Medline и EMBASE.

При анализе публикаций в 46 генах было выявлено 129 однонуклеотидных полиморфизмов, из которых 34 были сразу же исключены в связи с малой частотой встречаемости. Для оставшихся 95 полиморфизмов был проведен анализ репликации в материалах 82 пациентов, переживших онкозаболевание в детстве и не развивших опухоли ЦНС. В качестве контроля было взято дополнительно 228 образцов у здоровых доноров.

ДНК выделяли из периферической крови и слюны участников эксперимента. Генотипирование проводилось на матрице Illumina semicustom HumanExome+v1.1, разработанной специально для исследований группы детской онкологии (COG).

После получения результатов модель была сгенерирована и успешно подтверждена контрольным независимым сопоставленным исследованием 25 пациентов, переживших онкологическое заболевание, и данных 54 здоровых участников. Положительное прогностическое значение (ППВ) составило 60.9%, а отрицательное (НПВ) – 95.8% для всех вторичных опухолей ЦНС. Валидация модели для глиомы показала чувствительность – 84,6%, а специфичность 90,6% (ППВ- 68.6% НПВ- 90.6%). Для менингиомы эти результаты были чуть ниже (чувствительность 82.8%, специфичность 74,4% при ППВ- 74.4% НПВ – 86,5).

Была определена связь между конкретными однонуклеотидными полиморфизмами и вторичными опухолями ЦНС, включая rs15869 (BRCA2), rs1805389 (LIG4), rs25489 (XRCC1), rs1673041 (POLD1), rs8079544 (TP53) и rs11615 (ERCC1).

Было обнаружено что полиморфизм rs15869 (BRCA2) ассоциирован с повышенным риском развития глиомы и менингиомы. По мнению авторов, это может быть связано с воздействием повреждающих ДНК агентов и лучевой терапии в присутствии нарушения репарации ДНК.

Риск развития вторичной глиомы был связан преимущественно с тремя полиморфизма — rs2909430 (TP53), rs1805389 (LIG4) и rs15869 (BRCA2). Диапазон OR составил 3.7-19.7. Для менингиомы определяющими являются четыре однонуклеотидных полиморфизма — rs15869 (BRCA2), rs25489 (XRCC1), rs1801270 (CDKN1A) и rs1673041 (POLD1). OR в свою очередь варьировался от 2.0 до 9.6.

Данное исследование безусловно очень интересно и актуально, а представленная модель демонстрирует возможность идентификации пациентов с высоким риском развития вторичных опухолей ЦНС после проведения химиотерапевтического и лучевого лечения. Однако небольшое количество пациентов, включенных в исследование требует валидации метода на большей группе участников.

Подготовила Марина Тихонова

Источник

Автор публикации

не в сети 2 дня

Редакция

Комментарии: 0Публикации: 615Регистрация: 11-07-2017

Добавить комментарий

Авторизация
*
*
Регистрация
*
*
*
Генерация пароля